尿道感染类的炎症治疗大多数以抗生素的医治为主，绝大多数患者都可痊愈。在施以抗生素治疗前，通常会进行尿液检查，用抗生素持续治疗4至7天，症状就会明显缓解。对于少数会出现反复性泌尿道感染的患者，一定要再做尿液的细菌培养，找出致病菌种，避免再用已出现抗药性的抗生素，才能一举将顽强的细菌歼灭。
膀胱发炎，通常口服抗生素4至7天即可痊愈；若进展到急性的肾盂肾炎，就需住院接受静脉注射抗生素的治疗，直到完全没有发烧且持续48小时后，才改口服抗生素，整个抗生素疗程为10-14天。再者，临床上常见患者因担心用多了抗生素对身体不好，只要症状稍已缓解，就自行停药，殊不知治疗天数不足、治疗剂量不够，泌尿道里面的细菌未被杀光，少数侥倖存活下来的细菌，就会对那种抗生素产生抗药性，将来再用这种抗生素时，就失去效果，只好求助第二线、甚至第三线的抗生素。
像是ESBL这种具抗药性的大肠杆菌，由于已出现多重性菌株，目前只有一、两种针剂型抗生素可用，相当棘手。万一所有抗生素全都无效，再也找不到足以杀死细菌的武器，最后唯有举起白旗投降的份。所以服用抗生素千万不要自行停药，应遵从用药指示。治疗期间，除了抗生素的药物治疗外，病患应尽量摄取水份及富含维生素C的水果，保持良好卫生习惯。
